Η Αναστασία Μαργούτα είναι ειδικός παθολόγος. Διετέλεσε την ειδικότητά της στο Γενικό Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης «Παπαγεωργίου» και στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Ζυρίχης Ελβετίας, αποκτώντας τον τίτλο Ιατρικής Ειδικότητας Εσωτερικής Παθολογίας στην Θεσσαλονίκη.
Είναι κάτοχος Μεταπτυχιακού Διπλώματος Ιατρικής Σχολής ΑΠΘ και υποψήφια Διδάκτωρ ΑΠΘ.
